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1 / 11 84 pares de bases de ADN, a escala Este tramo mide unos 29 nm. Las barras inferiores dan la escala: una vuelta equivale a 10,5 pares de bases (3,57 nm) en disolución, mientras los manuales redondean a 10 pares y 3,4 nm. La secuencia se ha inventado para el modelo.
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Guía Piezas Controles
01 84 pares de bases de ADN, a escala Este tramo mide unos 29 nm. Las barras inferiores dan la escala: una vuelta equivale a 10,5 pares de bases (3,57 nm) en disolución, mientras los manuales redondean a 10 pares y 3,4 nm. La secuencia se ha inventado para el modelo.
02 La helicasa abre una horquilla El anillo de helicasa separa las hebras y el ADN forma una Y, la horquilla de replicación. Delante una topoisomerasa alivia la torsión, y detrás pequeñas proteínas de unión (verdes) evitan que las hebras simples vuelvan a cerrarse.
03 Cada fragmento empieza con ARN La ADN polimerasa solo añade a un extremo 3′ existente. La primasa lo resuelve escribiendo un cebador corto de ARN, las cuentas moradas, sobre el molde de la hebra retardada.
04 La hebra conductora crece de una pieza En el molde superior la polimerasa avanza en el mismo sentido que la horquilla, por lo que sigue añadiendo a la misma hebra (naranja) desde un cebador. Los colores de bases están desactivados para mostrar qué hebra es nueva.
05 La hebra retardada se hace en piezas La hebra nueva inferior debe crecer alejándose de la horquilla. La polimerasa construye un fragmento de Okazaki hacia atrás hasta el anterior, se suelta y empieza de nuevo en el siguiente cebador, dejando una fila de piezas.
06 Sin cebadores y con mellas selladas La ADN polimerasa I sustituye cada cebador de ARN por ADN, empezando desde el fragmento situado detrás. Queda un enlace ausente, una mella, que sella la ADN ligasa. Observa subir el contador Okazaki de fragmentos unidos.
07 Retirar una base incorrecta Aquí la polimerasa ha insertado G frente a T. Se detiene, retrocede un nucleótido, corta la base incorrecta e inserta la correcta. Desactiva Corrección de pruebas y la base incorrecta permanece mientras la horquilla se adelanta.
08 Tira tú de la helicasa Arrastra el anillo amarillo de helicasa por la hélice. La horquilla se abre tan rápido como tires, y Velocidad sigue tu mano. Tira hacia atrás y no ocurre nada: una helicasa avanza en un solo sentido, usando energía del ATP.
09 Horquilla rápida, fragmentos largos La primasa inicia un cebador nuevo a intervalos regulares, por lo que la longitud de cada fragmento de Okazaki depende de cuánto haya avanzado la horquilla entre ellos. En el modelo llega un cebador cada 2,8 segundos: 14 nt a 5 bp/s, 36 nt a 13 bp/s y 8 nt a 3 bp/s. En E. coli comienza un fragmento nuevo cada 1 a 2 segundos.
10 Tú eres la polimerasa Pulsa Emparejar la siguiente base. Una cuenta blanca marca la siguiente posición libre de la hebra conductora y un anillo rojo la base molde. Elige su pareja: A para T, G para C. Con Corrección de pruebas activada, una elección incorrecta vuelve a cortarse; desactivada, el apareamiento incorrecto permanece.
11 Dos copias, cada una mitad antigua Cuando pasa la horquilla quedan dos dobles hélices. Cada una contiene una hebra antigua gris y otra nueva coloreada. Meselson y Stahl lo mostraron en 1958 con nitrógeno pesado, como esquematizan los tubos de la esquina.
ADN parental Las dos hebras antiguas, gris oscura y clara. Delante de la horquilla siguen enrolladas juntas, con 2 nm de diámetro y una vuelta cada 10,5 pares de bases. Detrás de la horquilla cada una termina en una copia distinta. Pares de bases A se empareja con T y C con G, un par cada 0,34 nm. Colores: A verde, T roja, G amarilla, C azul, U (en ARN) morada. Desactiva Colores de pares de bases para colorearlas por hebra. Topoisomerasa Actúa sobre la doble hélice delante de la horquilla. Abrir las hebras sobreenrolla el ADN situado delante; la topoisomerasa alivia la tensión cortando una hebra y volviéndola a sellar. Helicasa Rompe los enlaces de hidrógeno entre las bases y separa las hebras utilizando energía del ATP. Se dibuja como un anillo donde se separan las hebras. Proteínas de unión al ADN monocatenario Pequeñas proteínas (verdes) que recubren hebras simples desnudas cerca de la horquilla para que no vuelvan a emparejarse antes de copiarse. Se acumulan en el molde de la hebra retardada, que espera más tiempo. Primasa ARN polimerasa que escribe un cebador corto de ARN sobre el molde. La ADN polimerasa no puede iniciar una hebra sola; necesita el extremo 3′ libre del cebador. Cebadores de ARN Fragmentos cortos de ARN (cuentas moradas). Uno inicia la hebra conductora; cada fragmento de Okazaki de la hebra retardada necesita el suyo. Los cebadores reales tienen unos 5 a 10 nucleótidos; aquí son 5. ADN polimerasa y abrazadera Dos polimerasas (azules), una por hebra nueva, cada una sujeta al ADN por una abrazadera deslizante en forma de anillo. Solo añaden nucleótidos a un extremo 3′, por lo que cada hebra nueva crece de 5′ a 3′. Hebra conductora La hebra nueva (naranja) cuyo sentido de 5′ a 3′ apunta hacia la horquilla. Se fabrica de una pieza desde un único cebador y sigue el ritmo de la helicasa. Hebra retardada, fragmentos de Okazaki La otra hebra nueva (verde azulada, en dos tonos). Su sentido de 5′ a 3′ se aleja de la horquilla, por lo que se fabrica hacia atrás en fragmentos. Los del modelo tienen 14 nucleótidos; los reales unos 1200 en bacterias y 200 en eucariotas. ADN polimerasa I En bacterias esta enzima elimina cada cebador de ARN y rellena el hueco con ADN, usando como inicio el ADN del siguiente fragmento. En eucariotas RNasa H y otras enzimas realizan esta tarea. ADN ligasa Sella la mella entre dos piezas de ADN formando el último enlace fosfodiéster. Un destello señala cada sellado, y los fragmentos se convierten en una hebra. Apareamiento incorrecto Una base incorrecta insertada por la polimerasa. Con Corrección de pruebas activada, esta se detiene, la corta con su exonucleasa de 3′ a 5′ e inserta la correcta. Desactivada, el apareamiento incorrecto permanece (anillo).