شكل 54جولات
جولة داخل خلية: حيوانية ونباتية وبكتيرية
بعد تكبيرها مليون مرة تصير الميتوكوندريا بحجم أريكة تقريبًا، ويبلغ طول الإشريكية القولونية كاملةً 2 m، ويمشي الكينيسين الذي يسحب حويصلة بجانبك بسرعة 0.8 متر في الثانية.
لا يمكن عرض النموذج 3D على هذا الجهاز. يمكنك قراءة خطوات الدليل أدناه نصًّا.
1 / 14 خلية أكبر مليون مرةأنت واقف على الغشاء السفلي لخلية مكبرة مليون مرة، لذا ترتفع عيناك عنه 1.6 µm. تحرك بمفاتيح WASD أو مفاتيح الأسهم أو عصا التحكم، وارتفع أو انزل بمفتاحي R وF أو بالسهمين على اليمين. في النواة أمامك نافذة مفتوحة. زر «دليل الخلية» أعلى اليمين يعرض 78 شيئًا يمكنك زيارته.
اسحب للتدوير. استخدم عجلة الفأرة أو إصبعين للتكبير.
أين تقف
الخلية أصغر من أن نتخيلها. الرسم المعتاد في الكتاب المدرسي يضع النواة وبضع ميتوكوندريا وبعض الخطوط المتموجة من الشبكة الإندوبلازمية داخل دائرة، كلها بالحجم نفسه تقريبًا وكلها تطفو في فراغ. يأخذ هذا المعروض خلية حيوانية واحدة، ويكبرها مليون مرة، ويتيح لك أن تتجول داخلها على ارتفاع عين عادي. كل شيء مرسوم بالأحجام المقيسة في خلايا حقيقية، فالميتوكوندريا كبسولة يمكنك الجلوس عليها، والريبوسوم خرزة داكنة بحجم كرة زجاجية كبيرة.
شكل الخلية مثل خلية منبسطة على طبق زجاجي: قبة منخفضة طولها 30 µm وعرضها 24 µm وارتفاعها 8 µm في الوسط. تبدأ على أرضيتها، وهي جزء الغشاء البلازمي الملتصق بالزجاج. تملأ النواة الوسط، وتلتف الشبكة الخشنة حول جانبها الأيسر، وتقع كومة جولجي على يمينها. تتناثر الميتوكوندريا والجسيمات الحالّة في الأنحاء، وتنتشر الأنيبيبات الدقيقة كالمروحة من نقطة بجوار النواة، وتركبها حويصلات صغيرة نحو حافة الخلية.
لماذا كُبّر النموذج مليون مرة
الخيار البديهي أن تُكبَّر الخلية بما يكفي ليتسع لها جسمك. تكبير 100,000 مرة لا يكفي. بهذا المقياس تصير الخلية التي عرضها 20 µm فقاعة عرضها 2 m، وتكون النواة أصغر من رأسك. والشخص الذي طوله 1.6 m يعادل 16 µm، أي أطول من الخلية كلها.
عند تكبير 1,000,000 مرة تصبح الأرقام سهلة القراءة. المتر في النموذج ميكرومتر في الخلية، والمليمتر نانومتر. وارتفاع عينك البالغ 1.6 m يمثل 1.6 µm. يُظهر ذلك مربع المقياس في الزاوية العليا اليسرى، ويُعاد رسم شريطه لما هو أمامك مباشرة. إذا نظرت إلى جدار على بعد 3 m، أظهر الشريط كم يبدو طول 1 µm على تلك المسافة.
الأحجام في النموذج
هذه هي الأجزاء الرئيسية والأحجام التي بُنيت بها. الأرقام الحقيقية نطاقات، لأن الخلايا تختلف من نوع إلى آخر.
| الجزء | الحجم الحقيقي | الحجم في النموذج |
|---|---|---|
| الخلية كلها (منبسطة على الزجاج) | عرضها 20 إلى 40 µm | 30 × 24 × 8 m |
| النواة | عرضها 2 إلى 10 µm | 9 × 6 × 7.6 m |
| الميتوكوندريا | عرضها نحو 1 µm وطولها 2 µm | عرضها 0.84 إلى 1 m وطولها 2 إلى 2.8 m |
| الجسيم الحالّ | 0.1 إلى 1.2 µm | 0.5 إلى 0.7 m |
| الثقب النووي | نحو 120 nm | 12 cm |
| الأنيبيب الدقيق | عرضه 25 nm | عرضه 2.5 cm |
| الريبوسوم | 25 إلى 30 nm | نحو 2.8 cm |
| أنبوب الشبكة الملساء | 30 إلى 100 nm | 6 cm |
| الغشاء البلازمي | سمكه 4 إلى 10 nm | سمكه 4 إلى 10 mm |
| خطوة الكينيسين | 8 nm | 8 mm |
يبلغ حجم الخلية نحو 3,000 µm³. يستخدم كتاب Cell Biology by the Numbers قيمة 2,000 µm³ تقديرًا تقريبيًا للخلية البشرية، ومعظم الخلايا بين 500 و4,000 µm³، ويستخدم 3,000 µm³ للخلية الثديية النموذجية في أمثلته المحلولة. تصل خلايا HeLa المنبسطة على شريحة إلى نحو 40 µm عرضًا ولا يتجاوز ارتفاعها بضعة ميكرومترات، ولهذا جاء النموذج قبة منخفضة لا كرة.
تحقق من بعض الأرقام بنفسك
قف بجانب الميتوكوندريا المفتوحة قرب نقطة البداية. عرضها 1 m، فقمتها أدنى قليلًا من مستوى عينك. وفي الخلية الحقيقية هذا 1 µm، أي نحو جزء من مئة من عرض شعرة الإنسان.
الغشاء أصعب الأجزاء رؤية. سمكه 4 إلى 10 nm، فهو في النموذج 4 إلى 10 mm، بسمك قلم رصاص تقريبًا، يلتف حول غرفة طولها 30 m. يشبّهه كتاب Cell Biology by the Numbers بجلد الطائرة مقارنةً بعرض جسمها. لهذا رُسمت رقعة في الجدار الأيمن أسمك من الباقي 20 مرة. في تلك الرقعة يبلغ عرض كل رأس دهني 16 mm بدل 0.8 mm، ويمكنك أن تعد الطبقتين.
DNA النواة هو الرقم الذي لا يتسع إطلاقًا. تحمل الخلية البشرية نحو 2 m من DNA (نسختان من جينوم يبلغ نحو 3 مليارات زوج قاعدي، 0.3 nm لكل زوج قاعدي). في النموذج سيكون ذلك 2,000 km من الخيط محشورة في كرة طولها 9 m. الخيوط البنفسجية التي تراها داخل النافذة عينة صغيرة رُسمت لإظهار الملمس.
الغشاء في مقطع عرضي
للفوسفوليبيد رأس يمتزج بالماء وذيلان لا يمتزجان به. في الماء تختبئ الذيول منه بأن تصطف ذيلًا إلى ذيل، فتتكون طبقتان على وجهيهما الخارجيين رؤوس. عمق كل طبقة نحو 2 nm، فسمك قلب الطبقة المزدوجة نحو 4 nm. تستقر البروتينات في هذا الغشاء الرقيق. البرميل الأزرق في الرقعة المكبرة قناة تعبر الطبقتين، والبروتين الذي تزينه خرزات خضراء من الخارج يحمل سلسلة من السكريات.
الغشاء سائل. تنزلق الدهون جانبيًا متجاوزة جيرانها طوال الوقت، لكنها نادرًا جدًا ما تنقلب من طبقة إلى أخرى، فتحتفظ الطبقتان بمزيجين مختلفين من الدهون. أما النموذج فيثبتها في مكانها.
النواة وثقوبها
الغلاف النووي غشاءان، داخلي وخارجي، بينهما فجوة من بضع عشرات النانومترات. تُظهر النافذة المفتوحة في مقدمة النواة الحافتين، والمسافة بينهما في النموذج نحو 4 cm. يستمر الغشاء الخارجي في الشبكة الخشنة، ولهذا تبدأ صفائح الشبكة في النموذج بجوار النواة مباشرة.
تعبر الثقوب النووية الغشاءين معًا. كل ثقب حلقة من البروتينات عرضها نحو 120 nm في وسطها قناة، وفي نواة الحيوان الفقاري نحو 2,000 منها. يخرج RNA المرسال ووحدات الريبوسوم الفرعية عبر الثقوب، وتدخل البروتينات اللازمة داخل النواة. يعرض النموذج 300 إلى 1,100 ثقب حسب جهازك.
في الداخل، النوية منطقة كثيفة بلا غشاء حولها، مرسومة بعرض 2 µm في النموذج. تتكون حول جينات RNA الريبوسومي، وفيها يُجمَّع نصفا الريبوسوم قبل تصديرهما.
أين تُصنع البروتينات وتُعبّأ
يقرأ الريبوسوم RNA المرسال ويربط الأحماض الأمينية في سلسلة. الريبوسومات الطافية في العصارة الخلوية تصنع بروتينات تبقى في العصارة. وحين تحمل بداية البروتين الجديد إشارة إلى الشبكة، يرسو الريبوسوم على الشبكة ويغذي السلسلة النامية عبر الغشاء إلى داخل الكيس، وهذا ما يجعل الشبكة تبدو خشنة. أما الشبكة الملساء فلا ريبوسومات عليها. إنها شبكة من أنابيب عرضها 30 إلى 100 nm تصنع الدهون وتخزن الكالسيوم.
من الشبكة تنتقل البروتينات في حويصلات صغيرة إلى جهاز جولجي. في الخلية الثديية 40 إلى 100 كومة من جولجي، تتجمع عادة قرب الجسيم المركزي، وفي كل كومة أربعة إلى ثمانية صهاريج. يعرض النموذج كومة واحدة من ستة. تدخل البروتينات من الجهة القريبة من الشبكة، وتُشذَّب سكرياتها وتُضاف إليها وهي تعبر، وتخرج من الجهة البعيدة في حويصلات متجهة إلى الغشاء أو الجسيمات الحالّة أو حجيرات أخرى.
الكينيسين يمشي على أنيبيب دقيق
الأنيبيبات الدقيقة أنابيب مجوفة عرضها نحو 25 nm، مبنية عادة من 13 صفًا من التوبيولين. كل صف سلسلة من أزواج توبيولين ألفا وبيتا تتكرر كل 8 nm. تبدأ معظم الأنيبيبات الدقيقة عند الجسيم المركزي بجوار النواة وتمتد نحو حافة الخلية. وهي صلبة ومستقيمة تقريبًا على المسافات داخل الخلية.
للكينيسين-1 رأسان محركان يربطهما ساق طويل ملتف، وذيل يمسك الحمولة. يمشي بتبادل اليدين، كما يصفه PDB-101. يبقى أحد الرأسين مرتبطًا بالأنيبيب بينما يفلت الآخر، ويتأرجح متجاوزًا إياه، ويرتبط على بعد 16 nm إلى الأمام. كل خطوة تحرك الحمولة 8 nm وتستهلك جزيء ATP واحدًا. يذكر كتاب Cell Biology by the Numbers نحو 800 nm في الثانية للكينيسين التقليدي في أنبوب الاختبار، مع نحو 100 خطوة قبل أن يسقط.
عند تكبير مليون مرة تصبح 800 nm في الثانية 0.8 m في الثانية، أي سرعة مشي بطيء. لكن الرأسين يخطوان نحو 100 خطوة في الثانية، وهذا أسرع كثيرًا من أن تتابعه على الشاشة. لذلك تشغّل خطوة الدليل الخاصة بالكينيسين الحركة البطيئة بسرعة 1/20 من السرعة الحقيقية، لترى كل رأس يتأرجح متجاوزًا الآخر.
الميتوكوندريا والجسيمات الحالّة
للميتوكوندريا غشاءان. الخارجي أملس. والداخلي مطوي في أعراف تمنحه سطحًا كبيرًا للبروتينات التي تصنع ATP. يصف كتاب Cell Biology by the Numbers الميتوكوندريا النموذجية بأنها كبسولة طولها نحو 2 µm وعرضها 1 µm، مع أنها في كثير من الخلايا تتصل في شبكات متفرعة طولها عشرات الميكرومترات. يستخدم النموذج عشر كبسولات منفصلة ويفتح إحداها لترى الأعراف.
الجسيمات الحالّة أكياس تحوي أكثر من 60 نوعًا من الإنزيمات الهاضمة، وفي الخلية عادة المئات منها. يعرض النموذج ستة. يُحفظ داخلها عند pH 4.5 إلى 5، وتعمل الإنزيمات على أفضل نحو عند هذه الحموضة. أما العصارة الخلوية حولها فعند pH 7.2 تقريبًا، حيث لا تعمل الإنزيمات كما ينبغي، فلا يهضم الجسيم الحالّ المثقوب بقية الخلية.
التصغير عشر مرات ومئة مرة
عند تكبير مليون مرة يسهل التجول في الخلية، لكن أي شيء أصغر من نحو 20 nm يصبح فتاتًا عند قدميك. فالريبوسوم بحجم كرة زجاجية وقناة البوتاسيوم عرضها 8 mm. لترى الجزيئات تحتاج إلى درجة ثانية من التكبير، وتمنحك أزرار «الحجم» في أعلى اليمين درجتين أخريين: ×10 و×100.
لا تعيد الأزرار بناء الخلية، بل تصغّرك أنت. عند ×10 يصير المقياس 10,000,000 إلى 1، والمتر أمامك 100 nm، وعيناك على ارتفاع 160 nm عن الأرض. وعند ×100 يصير المقياس 100,000,000 إلى 1، والمتر 10 nm، وطولك 16 nm، أي بارتفاع بروتيازوم تقريبًا. يُظهر المربع في الزاوية العليا اليسرى دائمًا التكبير الحالي، وما يمثله المتر، وطولك الحقيقي، فتبقى الأرقام صادقة في أي درجة كنت. أما الخلية نفسها فلا تتغير. الميتوكوندريا التي كانت بحجم أريكة تصبح مبنى طوله 100 m، والمرور بجانبها عند ×100 يستغرق دقائق.
جزيئات بحجمها الحقيقي
رُسمت الجزيئات نماذج من الخرز، خرزة لكل جزء مطوي من البروتين، على طريقة رسوم RCSB PDB-101. بُنيت بحجمها الحقيقي ووُضعت حيث تعمل، ثم أُخفيت حتى تقترب بما يكفي لتظهر. ومن الطرف الآخر للخلية لا يكلف رسمها شيئًا.
في الخلية الحيوانية أربعة أماكن تجدها فيها:
- على غشاء الأرضية، قرب المقدمة إلى اليمين. قنوات بوتاسيوم ومضخات صوديوم وبوتاسيوم ومستقبلات وأكوابورينات تستقر في رقعة من الغشاء مرصوفة برؤوس دهون تفصل بينها 0.8 nm. وحفرة مغلفة بالكلاثرين، قفص عرضه نحو 100 nm، تسحب برعمًا من الغشاء إلى الداخل. تعبر الأرضية خيوط أكتين عرضها 7 nm، يمشي على أحدها محرك ميوسين V، وبالقرب منها خيط متوسط يشبه الحبل.
- في الزحام المجاور لها. صندوق طول ضلعه 100 nm مملوء ببروتينات بكثافة العصارة الخلوية الحقيقية، نحو 3 ملايين في كل ميكرومتر مكعب. عند ×100 يصير جدارًا من الجزيئات يمكنك أن تندفع فيه. على حافته بروتيازوم ومرافق Hsp90 وحبيبة جليكوجين وسلسلة من الريبوسومات تقرأ RNA مرسالًا واحدًا.
- في النواة. مقطع من DNA ملفوف حول جسيمات نووية، يصنع عليه بوليميراز RNA II شريطًا من RNA، ومعقد ثقب نووي بكامل تفاصيله على الغلاف.
- على العضيات. ريبوسوم راسٍ على الشبكة الخشنة عبر قناة Sec61، وصف من إنزيمات تخليق ATP على الحافة المقطوعة للميتوكوندريا المفتوحة، ومحرك داينين تحت سكة الكينيسين.
الكثافات حقيقية حيث يذكر دليل الخلية ذلك (صندوق الزحام، أرضية الدهون)، ومخففة في غيرها، لأن الغشاء الحقيقي مكتظ بالبروتينات إلى حد يصعب معه تمييز القنوات.
خلية نباتية بالمقياس نفسه
ينقلك زر «الخلية» إلى خلية ورقة مبنية بالمقياس نفسه. طولها 40 µm وعرضها 24 µm وارتفاعها 20 µm، داخل جدار من السليلوز. يصف كتاب Cell Biology by the Numbers خلايا نباتية من هذا النوع تشغل الفجوة العصارية معظم حجمها، وهذا أول ما تلاحظه: كتلة نصف شفافة تملأ الوسط، وبقية الخلية محشورة في طبقة رقيقة حولها وفي غرفة عند أحد الطرفين حيث تقع النواة.
تستقر البلاستيدات الخضراء على الأرضية تحت الفجوة وعلى أحد الجدران. طولها في الرسم 5 µm، ضمن النطاق 4 إلى 6 µm المذكور للنباتات الوعائية، وإحداها مفتوحة لتُظهر جراناها، أي أكوام أكياس الثايلاكويد المسطحة، وحبيبة نشا. وعلى الجدار البعيد حقل نقر من الروابط البلازمية، قنوات عرضها نحو 50 nm، يصل هذه الخلية بجارتها. وعلى امتداد الجدار القريب تنساب العضيات حول حلقة من حبال الأكتين بسرعة 4 µm في الثانية، ضمن النطاق 1 إلى 100 µm في الثانية المقيس لانسياب السيتوبلازم. وعند ×100 داخل البلاستيدة المفتوحة تجد الروبيسكو، الإنزيم الذي يثبت ثاني أكسيد الكربون، والنظام الضوئي الثاني الذي يشطر الماء ويطلق الأكسجين.
بكتيريا بالمقياس نفسه
الخلية الثالثة هي الإشريكية القولونية (E. coli). يستخدم كتاب Cell Biology by the Numbers تقديرًا تقريبيًا عرضه نحو 1 µm وطوله 2 µm وحجمه 1 µm³، فيصير الكائن كله عند تكبير مليون مرة كبسولة طولها 2 m ممددة على الطبق، بحجم ميتوكوندريا واحدة من الخلية الحيوانية. وليس ذلك مصادفة في النموذج. فالميتوكوندريا تنحدر من بكتيريا ابتلعتها خلية أخرى في الماضي البعيد، وما زالت تحتفظ بجينوم صغير خاص بها. والشبكة على الطبق مرسومة بمربعات طول ضلعها 1 µm.
عند ×1 أنت أكبر من أن تدخل، لذا تبدأ الجولة عند ×10. في الداخل تملأ الريبوسومات معظم الفراغ حول شبه النواة، وهي كتلة الكروموسوم المتشابكة في الوسط بلا غشاء حولها. للغلاف فوقك ثلاث طبقات: الغشاء الداخلي وشبكة رقيقة من الببتيدوجليكان والغشاء الخارجي. تستقر في الغلاف محركات أسواط عرضها نحو 45 nm، يدير كل منها خيطًا لولبيًا نحو 100 مرة في الثانية، وتخبر شبكة من المستقبلات الكيميائية عند أحد الطرفين المحركات متى تعكس اتجاهها. ولأنه لا نواة تعترض الطريق، تبدأ الريبوسومات قراءة RNA المرسال وهو لا يزال يُصنع، ويعرض النموذج ذلك في موضعين قرب نقطة البداية.
دليل الخلية
يفتح زر «دليل الخلية» قائمة بـ 78 شيئًا يمكنك زيارته: 49 في الخلية الحيوانية، و14 في الخلية النباتية، و15 في البكتيريا. يمكنك البحث بالاسم، والتصفية حسب الخلية والنوع (العضيات والجزيئات والعمليات)، والترتيب حسب الحجم. اختيار أحدها يغيّر الخلية والحجم إن لزم ويمشي بك إلى موضع أمامه. ثم تعرض بطاقة حجمه الحقيقي، وعدده في الخلية، ووصفًا قصيرًا، ومصادره، وشريطًا يقارن حجمه ببروتين وريبوسوم والإشريكية القولونية وخلية حيوانية وطولك أنت بالحجم الحالي.
سبع عمليات لا تُعرض في الخلايا 3D: أطوار الانقسام المتساوي، ودورة الخلية، والصفيحة الخلوية في خلية نباتية تنقسم، والانشطار الثنائي في البكتيريا. وتعرض بطاقاتها بدلًا من ذلك رسمًا صغيرًا.
ماذا يفعل التكبير مليون مرة بالسرعات والمسافات
لأن 1 m في النموذج يساوي 1 µm في الخلية، يمكن تحويل أي طول برفع الوحدة ست درجات.
خلية عرضها 20 µm يكون عرضها في النموذج 20 m، أي طول حافلة ونصف متتابعتين.
ريبوسوم حجمه 25 nm يصبح 25 mm، أي 2.5 cm، بحجم كرة زجاجية كبيرة.
بروتين حجمه 5 nm يصبح 5 mm، مثل حبة أرز واقفة، وغشاء سمكه 5 nm يصبح سمكه 5 mm، طبقة يمكن إمساكها بين إصبعين تلتف حول قاعة طولها 30 m.
السرعات تتغير بالنسبة نفسها، لأن الزمن لا يُمدَّد.
يمشي الكينيسين بنحو 800 nm في الثانية، وهذا في النموذج 0.8 m في الثانية.
بروتين ينجرف بضعة ميكرومترات في ثانية يقطع بضعة أمتار.
أنت تمشي بنحو 1.4 m في الثانية، وهذا في الخلية الحقيقية 1.4 µm في الثانية، أسرع قليلًا من الكينيسين.
عبور طول الخلية البالغ 30 m يستغرق منك نحو 21 ثانية.
عند ×100 تصبح الخطوة نفسها 14 nm في الثانية، ولهذا يوجد في عنصر المشي ضبط سريع.
في الوحدات فخ واحد. المساحات تتغير بالتربيع والأحجام بالتكعيب.
ميتوكوندريون حجمه 1 µm³ يصبح 1 m³ في النموذج، مكعبًا طول ضلعه متر.
والخلية كلها، نحو 3000 µm³، تصبح 3000 m³، قاعة أكبر من مسبح أولمبي يتسع لنحو 2500 m³.
الأرقام في الجدول أعلاه أطوال. وحين يذكر هذا الدليل عددًا لكل خلية، فهو يقصد العدد في هذه الأمتار المكعبة الثلاثة آلاف.
كم عدد الجزيئات وكم يلزمها لتعبر
بحسب كتاب Cell Biology by the Numbers يوجد نحو 3 ملايين بروتين في كل ميكرومتر مكعب من الخلية، لذلك تحتوي خلية بشرية حجمها من 2000 إلى 4000 µm³ على نحو 10 مليارات (10¹⁰) بروتين.
بالنسبة إلى 3000 µm³ في هذا النموذج يكون الحساب 3000 × 3 ملايين، أي نحو 9 مليارات.
في النموذج يحتوي كل متر مكعب حولك على 3 ملايين منها.
متوسط المسافة بين بروتينين متجاورين هو الجذر التكعيبي لـ 1 µm³ مقسومًا على 3 ملايين، أي نحو 0.007 µm أو 7 nm، وهي على الشاشة 7 mm.
حجم البروتين النموذجي نحو 5 nm، فهي تكاد تتلامس.
هذه هي الكثافة التي يعيد صندوق الزحام إنتاجها. وباقي النموذج أكثر خلوًا بكثير.
الجزيئات في الخلية لا تسير في خط مستقيم. تدفعها جزيئات الماء هنا وهناك، وتسمى هذه الحركة الانتشار، ويزداد متوسط الزمن اللازم لقطع مسافة x مع مربع تلك المسافة.
لجسيم يتحرك في بُعد واحد: t ≈ x² / 2D، حيث D ثابت الانتشار.
وفي ثلاثة أبعاد يصبح 2 هو 6.
يعطي الكتاب قيمة D بنحو 100 µm²/s لبروتين متوسط الحجم في الماء، ونحو 10 µm²/s داخل الخلية. بهذه الأرقام:
- عبور خلية إشريكية قولونية، x = 1 µm: t ≈ 1 / 60، أي نحو 0.02 s. يذكر الكتاب نحو 0.01 s.
- عبور خلية HeLa، x = 20 µm: t ≈ 400 / 60، أي نحو 7 s. يذكر الكتاب نحو 10 s.
- على امتداد محور عصبي طوله 1 cm، x = 10,000 µm: t ≈ 10⁸ / 60، أي نحو 1.7 مليون s، قرابة ثلاثة أسابيع. يقول الكتاب نحو أسبوعين لأنه يقرّب D والمعامل.
محرك يتقدم بسرعة 1 µm في الثانية يحتاج من 2 إلى 3 ساعات ليقطع 1 cm، ولهذا تحمل الخلايا العصبية حمولتها على الأنيبيبات الدقيقة بدل انتظار انتشارها.
لكن على مقياس خلية واحدة تتقارب الطريقتان. عند 20 µm يحتاج المحرك إلى 20 s والانتشار إلى أقل من 10 s، فتترك الخلية الصغيرة الجزيئات تنتشر وتدّخر المحركات للحمولات الكبيرة أو التي يجب أن تصل إلى مكان محدد.
أفكار خاطئة شائعة
- «العضيات تطفو متباعدة في ماء فارغ». في الخلية الحقيقية يكون الهيولى هلامًا مزدحمًا والعضيات متقاربة، والشبكة الإندوبلازمية ممتدة تقريبًا في كل مكان. الفراغ الذي تمشي فيه في النموذج تبسيط ليتيح لك الحركة.
- «الجزيئات تعرف إلى أين تذهب». تجد معظمها شريكها بالمصادفة عن طريق الانتشار، ولا تتفاعل إلا إذا التقت بالاتجاه الصحيح. المحركات مثل الكينيسين استثناء لأنها تتبع مسارات، لكن على الحمولة أيضًا أن تجد المسار.
- «الكينيسين يمشي مثل الإنسان». يبدو ذلك في الرسوم المتحركة، لكن رأسيه صغيران بما يكفي ليدفعهما الماء المحيط بهما باستمرار. المشي أشبه بمسنن منع الارتداد، فكل ATP يجعل رأسًا يتأرجح إلى الأمام ويلتصق، فتتحول الرجفة إلى خطوات في اتجاه واحد.
- «النواة دماغ الخلية وتتحكم في كل شيء مباشرة». تحفظ النواة الجينوم وتنسخه وتصنع RNA، لكن البروتينات تُصنع في الهيولى وعلى الشبكة، وكثير من قرارات الخلية تبدأ من إشارات تصل إلى الغشاء. بل إن الميتوكوندريا تحتفظ بجينوم صغير خاص بها.
- «كل الخلايا تبدو مثل رسم الكتاب المدرسي». يعرض النموذج نوعًا واحدًا من الخلايا منبسطًا على الزجاج بأحجام الخلايا الأكثر دراسة. كرية الدم الحمراء بلا نواة وليف العضلة فيه نوى كثيرة، وأحجام الخلايا تمتد عبر عدة مراتب.
كيف يختلف النموذج عن الخلية الحقيقية
- العصارة الخلوية هنا شبه فارغة. تحوي الخلية الحقيقية نحو 3 ملايين بروتين في كل ميكرومتر مكعب. أما الذرات الطافية حولك فبضعة آلاف على الأكثر، وتنجرف ببطء بدل أن تتدافع بسرعة كبيرة.
- الريبوسومات مخففة. يرسم النموذج بضعة آلاف. وفي الخلية الحقيقية أكثر بكثير، مكتظة على الشبكة الخشنة حتى تبدو الصفائح مرصعة.
- الأكتين والخيوط المتوسطة متفرقة. تعبر حزم من الأكتين الأرضية، وتلتف بضعة خيوط متوسطة حول النواة، لكن شبكة الأكتين الكثيفة تحت الغشاء حُذفت لتبقى الممرات مفتوحة.
- الجزيئات مخفية من بعيد. لا تظهر نماذج الجزيئات إلا حين تقترب بما يكفي لرؤيتها، وتبقى ساكنة بدل أن تتقلب.
- معظم العضيات ساكنة. في الخلية الحية تتحرك الميتوكوندريا وتنقسم وتندمج، ويتغير شكل الشبكة من دقيقة إلى أخرى.
- في النواة نافذة. الغلاف الحقيقي مغلق إلا من ثقوبه.
- الألوان مختلقة. ليس للعضيات لون خاص بها في هذا الحجم. تُظهرها المجاهر الإلكترونية رمادية، وتستخدم صور التألق أصباغًا.
كيف تتحرك
على الحاسوب، استخدم WASD أو مفاتيح الأسهم للمشي، واسحب بالفأرة لتنظر حولك. يرفعك R ويتركك F تنزل من جديد. يجعلك Shift تتحرك أسرع. والنقر على الأرض يمشي بك إليها. على الهاتف، النصف الأيسر من الشاشة عصا تحكم والنصف الأيمن يدير نظرك. ويرفعك السهمان على اليمين أو ينزلانك.
في اللوحة على يمين المسرح ثلاثة صفوف. «الخلية» تبدّل بين الخلية الحيوانية والخلية النباتية والبكتيريا. «الحجم» يصغّرك إلى ×10 أو ×100 ويعيدك. «المشي» يضبط سرعتك على بطيء أو عادي أو سريع، وهذا مفيد عند ×100 حيث لا يقطع المشي العادي سوى 13 nm في الثانية. تُظهر الخريطة الصغيرة في أعلى اليسار موقعك من فوق؛ انقرها لتمشي إلى تلك البقعة.
تظهر بطاقات الأسماء حين تقترب من شيء ما، وعند ×100 تسمّي جزيئات منفردة. يعرض عنصر التحكم «كل بطاقات الأسماء» عددًا أكبر منها في آن واحد. وتأخذك قائمة «القطع» و«دليل الخلية» كلاهما مباشرة إلى ما تختاره.
أسئلة شائعة
هل يبدو داخل الخلية الحقيقية هكذا؟
الأحجام والمواضع تتبع قياسات حقيقية، لكن الخلية الحقيقية أشد زحامًا بكثير. تملأ البروتينات وRNA والجزيئات الصغيرة كل فجوة تقريبًا، والعضيات متقاربة أكثر مما في النموذج. لو رُسمت بكثافتها الحقيقية لما استطعت أن ترى أبعد من بضعة ميكرومترات في أي اتجاه.
لماذا للخلية أرضية؟
معظم الخلايا الحيوانية التي تُدرس في المختبر تُزرع على الزجاج أو البلاستيك، حيث تنبسط وتلتصق بالسطح. الأرضية هي جزء الغشاء البلازمي الملامس للطبق. أما في النسيج فتحيط بالخلية خلايا أخرى من كل جانب.
ما سرعة الكينيسين الحقيقية؟
يتحرك الكينيسين التقليدي نحو 800 nm في الثانية في أنبوب الاختبار، وقد يسرع أكثر داخل الخلايا. أي خطوات طولها 8 nm بمعدل نحو 100 خطوة في الثانية. وبمقياس النموذج هذا 0.8 m في الثانية، فهو بلا حركة بطيئة يمر بك بخطى متمهلة بينما يغيم رأساه.
هل تستطيع الحويصلة حقًا أن تركب أنيبيبًا دقيقًا كل هذه المسافة؟
نعم. تنقل الكينيسينات الحويصلات والعضيات وحمولات أخرى على الأنيبيبات الدقيقة، وينقل الداينين الحمولة في الاتجاه الآخر، نحو الجسيم المركزي. يفلت الكينيسين المنفرد عادة بعد نحو مئة خطوة، لكن الحمولة كثيرًا ما تحمل عدة محركات، فتنتقل من محرك إلى آخر وتواصل الحركة.
لماذا تظهر الميتوكوندريا كبسولات منفصلة؟
هذه صورة الكتاب المدرسي، وهي صحيحة في كثير من الخلايا، خاصة في مقاطع المجهر الإلكتروني. أما في الخلايا الحية فكثيرًا ما تشكل شبكات طويلة متفرعة لا تكف عن الانقسام والاندماج. والكبسولات المنفصلة أسهل رؤية.
كم ريبوسومًا في الخلية؟
يتوقف ذلك على نوع الخلية وسرعة نموها. يبين كتاب Cell Biology by the Numbers أن الإشريكية القولونية سريعة النمو تحوي نحو 72,000 ريبوسوم، أي أكثر من ثلث كتلتها الجافة. والخلية الحيوانية أكبر حجمًا بألف مرة أو أكثر وفيها أكثر من ذلك بكثير، فالآلاف القليلة في هذا النموذج عينة متفرقة.
لماذا أستطيع الطفو داخل النواة؟
النافذة مقطع مكشوف، مثل المقاطع في نماذج المحركات في المتاحف. في الخلية الحقيقية يكون الغلاف مغلقًا، ولا يستطيع شيء بحجمك أن يمر عبر ثقب نووي.
لماذا لا أستطيع دخول البكتيريا بالحجم العادي؟
لأنها عند تكبير مليون مرة لا يتجاوز طولها 2 m وعرضها 1 m، وعيناك على ارتفاع 1.6 m. وإذا صغرت عشر مرات صار طولك 160 nm وصارت البكتيريا نفقًا عرضه 10 m. وهذه علاقة الأحجام نفسها في الواقع: خلية الإشريكية القولونية بحجم ميتوكوندريا واحدة تقريبًا، والخلية الحيوانية تتسع لآلاف منها.
هل الجزيئات مكتظة حقًا إلى هذا الحد؟
في صندوق الزحام وأرضية الدهون، نعم. يقدّر كتاب Cell Biology by the Numbers محتوى الخلايا من البروتين بنحو 3 ملايين بروتين في كل ميكرومتر مكعب، والصندوق مملوء بهذه الكثافة. وفي غيره خُففت نماذج الجزيئات لتجد الجزيئات المنفردة، والذرات الطافية حولك ليست إلا كمية رمزية.
لماذا وسط الخلية النباتية فارغ إلى هذا الحد؟
الوسط هو الفجوة العصارية المركزية، كيس من الماء والأملاح والأصباغ. وفي كثير من خلايا الأوراق تشغل 80% من الحجم أو أكثر. ضغطها على الجدار هو ما يبقي الأجزاء الطرية من النبات متماسكة، ويذبل النبات حين تفقد الفجوات ماءها.
كيف تغيّر أزرار الحجم ما أراه؟
تجعلك أصغر بينما تبقى الخلية كما هي. عند ×10 يصير كل طول أمامك أكبر عشر مرات مما كان، فالريبوسوم الذي كان بحجم كرة زجاجية يصير بحجم كرة قدم. ويُظهر مربع المقياس دائمًا التكبير الحالي، وما يمثله المتر، وطولك أنت بالوحدات الحقيقية.
المصطلحات
- العضية: جزء من الخلية له وظيفته الخاصة، مثل النواة أو الميتوكوندريا.
- العصارة الخلوية: الهلام المائي الذي يملأ الخلية حول العضيات.
- الطبقة الفوسفوليبيدية المزدوجة: طبقتا جزيئات الدهون اللتان تكوّنان أغشية الخلية.
- الغلاف النووي: الغشاء المزدوج حول النواة.
- معقد الثقب النووي: حلقة بروتينية عرضها نحو 120 nm تشكل قناة عبر الغلاف النووي.
- الكروماتين: DNA ملفوف حول بروتينات الهستون، وهي الصورة التي يتخذها DNA في النواة.
- الشبكة الإندوبلازمية (ER): شبكة من الأكياس والأنابيب الغشائية. تحمل الشبكة الخشنة ريبوسومات، والملساء لا تحملها.
- الصهريج: كيس مسطح واحد من الشبكة أو من جهاز جولجي.
- الأعراف: طيات الغشاء الداخلي للميتوكوندريا.
- الأنيبيب الدقيق: أنبوب مجوف من التوبيولين عرضه نحو 25 nm.
- البروتين المحرك: بروتين يستخدم ATP للتحرك على خيط. يمشي الكينيسين والداينين على الأنيبيبات الدقيقة.
- ATP: ثلاثي فوسفات الأدينوسين، الجزيء الصغير الذي تستخدمه الخلايا لحمل الطاقة.
- الفجوة العصارية: كيس الماء الكبير في الخلية النباتية، يلفه غشاء يسمى الغشاء الفجوي (التونوبلاست).
- البلاستيدة الخضراء: العضية التي يجري فيها البناء الضوئي، وفي داخلها أكوام من الثايلاكويدات.
- الرابطة البلازمية: قناة عبر جدار الخلية النباتية تصل خليتين متجاورتين.
- شبه النواة: منطقة البكتيريا التي يقع فيها كروموسومها، بلا غشاء حولها.
- الببتيدوجليكان: شبكة من سلاسل السكر والببتيدات القصيرة تكوّن جدار الخلية البكتيرية.
- محرك السوط: المحرك الدوار في الغلاف البكتيري الذي يدير السوط.
- التكبير: كم مرة يكبر النموذج الشيء الحقيقي. يضرب ×10 و×100 القيمة الأولى 1,000,000.
المصادر
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big is a human cell? https://book.bionumbers.org/how-big-is-a-human-cell/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big are nuclei? https://book.bionumbers.org/how-big-are-nuclei/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big are mitochondria? https://book.bionumbers.org/how-big-are-mitochondria/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big is the endoplasmic reticulum of cells? https://book.bionumbers.org/how-big-is-the-endoplasmic-reticulum-of-cells/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What is the thickness of the cell membrane? https://book.bionumbers.org/what-is-the-thickness-of-the-cell-membrane/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What are the sizes of the cell's filaments? https://book.bionumbers.org/what-are-the-sizes-of-the-cells-filaments/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How fast do molecular motors move on cytoskeletal filaments? https://book.bionumbers.org/how-fast-do-molecular-motors-move-on-cytoskeletal-filaments/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big are the molecular machines of the central dogma? https://book.bionumbers.org/how-big-are-the-molecular-machines-of-the-central-dogma/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: The geography of the cell. https://book.bionumbers.org/the-geography-of-the-cell/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big are genomes? https://book.bionumbers.org/how-big-are-genomes/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How many ribosomes are in a cell? https://book.bionumbers.org/how-many-ribosomes-are-in-a-cell/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Kinesin. https://pdb101.rcsb.org/motm/64 (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Nuclear Pore Complex. https://pdb101.rcsb.org/motm/205 (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Ribosomal Subunits. https://pdb101.rcsb.org/motm/10 (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Nature Education, Scitable: Mitochondria. https://www.nature.com/scitable/topicpage/mitochondria-14053590/ (تاريخ الاطلاع 16 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How large are chloroplasts?. https://book.bionumbers.org/how-large-are-chloroplasts/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big is an E. coli cell and what is its mass?. https://book.bionumbers.org/how-big-is-an-e-coli-cell-and-what-is-its-mass/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What is the frequency of rotary molecular motors?. https://book.bionumbers.org/what-is-the-frequency-of-rotary-molecular-motors/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How fast do proteasomes degrade proteins?. https://book.bionumbers.org/how-fast-do-proteasomes-degrade-proteins/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How many ions pass through an ion channel per second?. https://book.bionumbers.org/how-many-ions-pass-through-an-ion-channel-per-second/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What are the rates of membrane transporters?. https://book.bionumbers.org/what-are-the-rates-of-membrane-transporters/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How long do the different stages of the cell cycle take?. https://book.bionumbers.org/how-long-do-the-different-stages-of-the-cell-cycle-take/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How many proteins are in a cell?. https://book.bionumbers.org/how-many-proteins-are-in-a-cell/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: How big is the average protein?. https://book.bionumbers.org/how-big-is-the-average-protein/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What is faster, transcription or translation?. https://book.bionumbers.org/what-is-faster-transcription-or-translation/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What is the pH of a cell?. https://book.bionumbers.org/what-is-the-ph-of-a-cell/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Milo, R. and Phillips, R., Cell Biology by the Numbers: What is the range of cell sizes and shapes?. https://book.bionumbers.org/what-is-the-range-of-cell-sizes-and-shapes/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 4.3 Eukaryotic Cells. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/4-3-eukaryotic-cells (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 4.2 Prokaryotic Cells. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/4-2-prokaryotic-cells (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 4.4 The Endomembrane System and Proteins. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/4-4-the-endomembrane-system-and-proteins (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 4.5 The Cytoskeleton. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/4-5-the-cytoskeleton (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 4.6 Connections between Cells and Cellular Activities. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/4-6-connections-between-cells-and-cellular-activities (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 10.2 The Cell Cycle. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/10-2-the-cell-cycle (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 10.5 Prokaryotic Cell Division. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/10-5-prokaryotic-cell-division (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 15.5 Ribosomes and Protein Synthesis. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/15-5-ribosomes-and-protein-synthesis (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 15.2 Prokaryotic Transcription. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/15-2-prokaryotic-transcription (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax, Biology 2e, 3.4 Proteins. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/3-4-proteins (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: ATP Synthase. https://pdb101.rcsb.org/motm/72 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Potassium Channels. https://pdb101.rcsb.org/motm/38 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Sodium-Potassium Pump. https://pdb101.rcsb.org/motm/118 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Adrenergic Receptors. https://pdb101.rcsb.org/motm/100 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Aquaporin. https://pdb101.rcsb.org/motm/173 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Clathrin. https://pdb101.rcsb.org/motm/88 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Proteasome. https://pdb101.rcsb.org/motm/166 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Hsp90. https://pdb101.rcsb.org/motm/108 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Chaperones. https://pdb101.rcsb.org/motm/32 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: RNA Polymerase. https://pdb101.rcsb.org/motm/40 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Nucleosome. https://pdb101.rcsb.org/motm/7 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Ribosome. https://pdb101.rcsb.org/motm/121 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Elongation Factors. https://pdb101.rcsb.org/motm/81 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Actin. https://pdb101.rcsb.org/motm/19 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Microtubules. https://pdb101.rcsb.org/motm/175 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Dynein. https://pdb101.rcsb.org/motm/176 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Myosin. https://pdb101.rcsb.org/motm/18 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Rubisco. https://pdb101.rcsb.org/motm/11 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Photosystem II. https://pdb101.rcsb.org/motm/59 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Flagellar Motor. https://pdb101.rcsb.org/motm/300 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Pilus Machine. https://pdb101.rcsb.org/motm/211 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Penicillin-binding Proteins. https://pdb101.rcsb.org/motm/29 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Catalase. https://pdb101.rcsb.org/motm/57 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: SNARE Proteins. https://pdb101.rcsb.org/motm/167 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Vacuolar ATPase. https://pdb101.rcsb.org/motm/219 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Glycogen Phosphorylase. https://pdb101.rcsb.org/motm/24 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB-101, Molecule of the Month: Cellulose Synthase. https://pdb101.rcsb.org/motm/254 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 106729: Diameter of peroxisome (0.1 to 1.0 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=106729 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 113930: Organelle numbers in COS-7 cells (lipid droplets, peroxisomes, lysosomes about 90 to 190 each). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=113930 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 104378: Diameter of late endosome in HeLa cells (0.76 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=104378 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 104387: Diameter of late endosome, Rab9-depleted HeLa cells (0.42 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=104387 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Fujimoto and Parton, Not Just Fat: The Structure and Function of the Lipid Droplet, Cold Spring Harb Perspect Biol 2011 (PMC3039932). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC3039932/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 105741: Size of canonical centriole (about 0.5 × 0.2 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=105741 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 106125: Diameter of intermediate filaments (8 to 10 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=106125 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 112144: Number of clathrin-coated structures per cell (about 9,000). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=112144 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 112147: Clathrin-coated pit mean lifetime (about 40 s). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=112147 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 104385: Diameter of endocytic vesicle (100 ± 30 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=104385 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- MetaCyc (SRI International): glycogen, β particles about 20 to 30 nm. https://biocyc.org/META/new-image?object=Glycogens (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 107396: Beta hairpin folding time (6 µs). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=107396 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 111269: GFP folding time (600 s). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=111269 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 102727: Diameter of a vesicle (40 to 80 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=102727 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax Biology 2e, 5.4 Bulk Transport. https://openstax.org/books/biology-2e/pages/5-4-bulk-transport (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 102983: Diameter of entire mitotic chromosome (1,400 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=102983 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Betterton and McIntosh, Regulation of chromosome speeds in mitosis, Cell Mol Bioeng 2013 (PMC4578309). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4578309/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Focus on cell walls, Plant Physiology 2024 (PMC10756750). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10756750/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100594: Plasmodesmata diameter (50 nm, 20 to 200). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100594 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100593: Plasmodesmata per µm² of cell wall (2 to 10). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100593 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Zeeman et al., Starch Synthesis in Arabidopsis. Granule Synthesis, Composition, and Structure, Plant Physiol 2002 (PMC161669). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC161669/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Goldstein and van de Meent, A physical perspective on cytoplasmic streaming, Interface Focus 2015 (PMC4590424). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4590424/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 104947: Width of cell envelope of E. coli B (28.7 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=104947 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 108581: Thickness of peptidoglycan (Gram-negative a few nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=108581 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 109343: Diameter of bacterial flagellum (about 20 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=109343 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100095: Typical length of E. coli flagella (5 to 10 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100095 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100105: Diameter of E. coli pili (7 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100105 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100104: Length of E. coli pili (1 to 2 µm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100104 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 101473: Number of pili per E. coli cell (100 to 300). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=101473 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- Briegel et al., Universal architecture of bacterial chemoreceptor arrays, PNAS 2009 (PMC2761316; E. coli array about 53,000 nm², about 5,200 receptors). https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC2761316/ (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- OpenStax Microbiology, 3.3 Unique Characteristics of Prokaryotic Cells. https://openstax.org/books/microbiology/pages/3-3-unique-characteristics-of-prokaryotic-cells (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- RCSB PDB 3DKN: Sec61 in the canine ribosome-channel complex. https://www.rcsb.org/structure/3dkn (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100121: Diameter of 70S ribosome (26 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100121 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)
- BioNumbers BNID 100483: Ribosome diameter (30 nm). https://bionumbers.hms.harvard.edu/bionumber.aspx?id=100483 (تاريخ الاطلاع 17 أكتوبر 2026)





